RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)-细胞/细菌培养-试剂-生物在线
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RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)

RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)

商家询价

产品名称: RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)

英文名称: RNase Viability Assay Kit (Fluorescent Labeling) RNase 活性检测试剂盒(荧光标记法)

产品编号: 41309ES96

产品价格: 2695.00

产品产地: Yeasen

品牌商标: Yeasen

更新时间: 2024-12-10T11:21:51

使用范围: null

规格 价格
1x96T 2695.0
5x96T 11315.0
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产品简介

 

RNase活性检测试剂盒(荧光标记法)使用一种新型RNA底物,其一端标记有荧光报告基团分子(Fluor),另一端标记有淬灭基团。在不存在RNase时,淬灭基团的物理接近会将荧光报告基团中的荧光淬灭到极低水平。当有RNase时,RNA底物被水解,荧光报告基团和淬灭基团在溶液中的空间上发生分离,这导致Fluor在被适当波长的光激发时发出明亮的荧光,该荧光可以通过多功能酶标仪(含荧光模块)和基于滤光片或单色器的荧光计进行检测。

RNase活性检测试剂盒(荧光标记法)采用底物荧光标记法,可定量或定性的检测单个样品中的RNase,从而判断样本是否有RNase污染。

 

产品信息

 

货号

41309ES96 / 41309ES97

规格

1×96 T / 5×96 T

 

组分信息

 

组分编号

组分名称

41309ES96

41309ES97

41309-A

RNase Substrate

1 tube

5×1 tube

41309-B

10×RNase buffer

1 mL

5 mL

41309-C

RNase A (≈1×10-4 U/μL)

100 μL

500 μL

41309-D

DEPC-treated Water

10 mL

50 mL

41309-E

Surface RNase Remover

50 mL

250 mL

 

运输和储存条件

 

1. 所有组分均干冰运输,有效期1年。

2. 收到货后,请先检查共5个组分是否齐全,再将41309-E组分2-8℃保存,其它组分-25~-15℃保存,避免反复冻融。

 

注意事项

 

1. 本产品仅作科研用途。

2. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。

3. 使用本试剂前请仔细阅读本说明书,实验应规范操作,包括样本处理、反应体系的配制及加样。

4. 每个组分在使用前都应充分震荡混匀,低速离心。

5. 加样和配液步骤请严格在冰上操作,以减缓上机前酶对底物的消耗。

6. 实验需使用低吸附耗材以降低酶损耗。

7. 定量实验需使用黑色酶标板以最大程度减少本底荧光。

 

使用说明

 

1. 适用机型

包含但不限于以下仪器:

Thermo Scientific: Invitrogen Qubit 4;

Molecular Devices: SpectraMax M3.

2实验前准备

1)在整个实验开始前,请先使用试剂盒中的Surface RNase Remover对实验环境进行处理(可稀释10倍进行喷洒或擦拭,具体可参考翌圣10609ES60使用说明书),以降低RNase污染。

2)本品可对具备活性的RNase进行检测及估值,在实验过程中可根据实际情况选择定性检测或者定量检测方法。

3定性检测方法

使用终点法在荧光仪或酶标仪上对待测样本进行读数,以Thermo公司Invitrogen Qubit 4荧光仪为例:

1)溶解RNase Substrate:取1管RNase Substrate干粉,高速离心,缓慢打开瓶盖加入1 mL DEPC-treated Water备用。

2)配制反应体系:每次实验均需制备阴性对照、阳性对照和待测样本体系。具体操作如下(按顺序加入下列试剂并混匀):

阴性对照反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

160

10×RNase buffer

20

RNase Substrate

20

总体积

200

表1 阴性对照反应体系

阳性对照反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

140

10×RNase buffer

20

RNase Substrate

20

5 pg/μL RNase A*

20

总体积

200

表2 阳性对照反应体系

*试剂盒C组分的RNase A参考品稀释20倍约为5 pg/μL的RNase A。

待测样本反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

140

10×RNase buffer

20

RNase Substrate

20

待测样本

20

总体积

200

表3 待测样本反应体系

*若待测样本污染较轻可增加待测样本体积,最大可增加至160 μL,相应减少DEPC-treated Water添加量,最小可减少至0,保持总体积不变。

3)检测初始荧光值:以Qubit4为例,对阴性对照、阳性对照和待测样本进行检测,选择“Fluorometer”进入荧光检测界面后,再选择“Blue”进行检测,并记录初始荧光值“RFU0”。

4)37℃孵育读值:将阴性对照、阳性对照和待测样本均放入37℃恒温箱孵育60 min后,重复步骤3,记录终末荧光值“RFU60”。5)结果判读:若阴性对照荧光值孵育前后变化不超过50%,阳性对照RFU60远大于2RFU0,且待测样本RFU60≥2RFU0,则判定待测样本被RNase污染。

4定量检测方法

使用多功能酶标仪对RNase进行实时监测并定量,使用此方法可以获得RNase消化底物的实时曲线。以Molecular Devices公司SpectraMax M3多功能酶标仪为例:

1)溶解RNase Substrate*:取1管RNase Substrate干粉,高速离心,缓慢打开瓶盖加入1 mL DEPC-treated Water备用,该干粉加入DEPC水后,可分装置于-25~-15℃短期保存(不超过3个月),使用时避免反复冻融。

2)稀释RNase A**:对试剂盒中RNase A梯度稀释,浓度依次为5 pg/μL、2.5 pg/μL、1 pg/μL、0.1 pg/μL。操作如下:

a. 取1.5 mL洁净离心管,加入495 μL DEPC-treated Water,再加入5 μL 10×RNase buffer,即获得500 μL 0.1×RNase buffer,用于后续配置梯度稀释液,配置前请将溶液轻微振荡混匀。

b. 取5支洁净的1.5 mL离心管,分别标记为Std0、Std1、Std2、Std3、Std4。

c. 在标记为Std0***的1.5 mL离心管中加入45 μL 0.1×RNase buffer和5 μL试剂盒中提供的RNase A(≈1×10-4 U/μL),即稀释为10 pg/μL(≈1×10-5 U/μL)的RNase A。

d. 在Std1、Std2、Std3、Std4管中先分别加入下表所示体积的0.1×RNase buffer,再进行梯度稀释,具体稀释方法如下:

稀释管

稀释比例

终浓度

Std1

30μL Std0 + 30μL 0.1×RNase buffer

5 pg/μL

Std2

30μL Std1 + 30μL 0.1×RNase buffer

2.5 pg/μL

Std3

20μL Std2 + 30μL 0.1×RNase buffer

1 pg/μL

Std4

5μL Std3 + 45μL 0.1×RNase buffer

0.1 pg/μL

表4 标准品梯度稀释

*为减少反复冻融次数和避免污染,建议初次使用时将稀释好的RNase Substrate分装储存于-25~-15℃。

**已知试剂盒中的RNase A浓度为≈1×10-4 U/μL,且对于RNase A的单位U和pg的换算关系为5×10-7 U≈0.5pg。

***Std0配制:将试剂盒中RNase A由1×10-4 U/μL稀释至1×10-5 U/μL,因5×10-7 U≈0.5pg,则1×10-5 U≈10pg,故1×10-5 U/μL≈10pg/μL。

3)标准品和待测样本的反应体系配制:

a. 标准品和阴性对照的Mix混合液配制:通常包括4个浓度梯度的RNase A参考品标准曲线和1个无模板对照NTC共5个样本,每个样本2个重复孔,再加1孔的损失量,共计11个孔。具体操作如下(按顺序加入下列试剂并混匀):

Mix混合液

体积(μL)

DEPC-treated Water

770 (11*70)

10×RNase buffer

110 (11*10)

RNase Substrate

110 (11*10)

总体积

990 (11*90)

表5 Mix混合液配制体系

标准品和阴性对照反应体系配制:将上述配制的Mix混合液以90 μL/孔进行分装,再添加10 μL/孔稀释好的RNase A参考品或10 μL/孔的阴性对照(可用0.1×RNase buffer作为阴性对照)。具体操作如下:

标准品反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

70

10×RNase buffer

10

RNase Substrate

10

RNase A参考品梯度稀释液

10

总体积

100

表6 标准品反应体系

阴性对照反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

70

10×RNase buffer

10

RNase Substrate

10

0.1×RNase buffer

10

总体积

100

表7 阴性对照反应体系

b. 待测样本反应体系配制(按顺序加入下列试剂并混匀):

待测样本反应体系

体积(μL)

DEPC-treated Water

70

10×RNase buffer

10

RNase Substrate

10

待测样本*

10

总体积

100

表8 待测样本反应体系

*若待测样本污染较轻可增加待测样本体积,最大可增加至80 μL(待测样本的本底检测与之保持一致),相应的减少DEPC-treated Water添加量,最小可减少至0,保持反应体系总体积不变。

c. 待测样本的本底检测反应体系配制:

待测样本的本底反应体系*

体积(μL)

DEPC-treated Water

90

待测样本**

10

总体积***

100

表9 待测样本的本底反应体系

*建议每次进行RNase活性检测时,针对每个初次测试的待测样本都增加不含RNase Substrate的本底荧光检测,若本底荧光偏高则计算时应减去。

**每次进行RNase活性检测实验时,标准品、阴性对照、待测样本、待测样本的本底检测等都至少做2个重复孔。

***为确保检测的准确性,所有样本进行加样时,请务必在冰上操作。

4)下表为参考板位:

 

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

标准曲线Std1

标准曲线Std1

 

待测样本TS1

待测样本TS1

TS1本底检测

TS1本底检测

 

 

 

 

 

B

标准曲线Std2

标准曲线Std2

 

待测样本TS2

待测样本TS2

TS2本底检测

TS2本底检测

 

 

 

 

 

C

标准曲线Std3

标准曲线Std3

 

待测样本TS3

待测样本TS3

TS3本底检测

TS3本底检测

 

 

 

 

 

D

标准曲线Std4

标准曲线Std4

 

待测样本TS4

待测样本TS4

TS4本底检测

TS4本底检测

 

 

 

 

 

E

 

 

 

待测样本TS5

待测样本TS5

TS5本底检测

TS5本底检测

 

 

 

 

 

F

 

 

 

待测样本TS6

待测样本TS6

TS6本底检测

TS6本底检测

 

 

 

 

 

G

 

 

 

待测样本TS7

待测样本TS7

TS7本底检测

TS7本底检测

 

 

 

 

 

H

NTC

NTC

 

待测样本TS8

待测样本TS8

TS8本底检测

TS8本底检测

 

 

 

 

 

表10 上机参考板位

该示例是对RNase活性检测的荧光标记法的操作展示,检测样本包括:4个浓度梯度的RNase A标准曲线、1个无模板对照NTC、8个待测样本TS、8个待测样本对应的本底检测。建议每个样本做2个重复孔。

5)仪器设置:使用酶标仪进行本实验,选择96孔板动力学模式以及荧光检测模块,选择中等增益,设置激发光490 nm,发射光520 nm;以1 min间隔读取数据,37℃恒温连续读数1 h(视待测物污染情况而定),此方法可实时监控体系动态。

6)结果判读:

a. 若RFU60≥2RFU0,则判定待测样本被RNase污染。

b. 若判定样本已污染,则制作标准曲线检测待测样本RNase污染含量(以下示例显示总体系的污染含量,如:标准品5 pg/μL,加样量10 μL,即总体系含量50 pg):

c. 以标准品开始读数时的前几分钟(可从时间曲线上判断线性增长期并选择合适的时间点,如下图一般选择0-3 min)所得数据制作标准曲线,再结合标准曲线和待测样本在此时间点的荧光值可得其RNase污染的估值,也可通过实时荧光曲线趋势判断待测样本中RNase的污染情况。

d. 示例:已知待测样本的RFU60≥2RFU0,选择2 min时标准品各稀释梯度对应的RFU制作标准曲线(如下图),将待测样本2 min时的RFU值代入标曲公式,即得待测样本整体的RNase活性浓度。


   【注】:

  1. 该试剂盒测定的是待测样本体系整体的RNase活性残留。
  2. 试剂盒利用RNase对底物特异性切割的特性进行检测,因此具有使蛋白质变性及含有使RNA单链断裂的物质不适用此试剂盒。
  3. 深色液体会对荧光收集产生影响,可能会影响结果准确性。
  4. 部分待测样本由于过酸、过碱或盐离子浓度过高抑制RNase的活性,可视情况对待测样本进行稀释后检测。
  5. 在使用定量方法检测时,仪器有时初始荧光值会虚高,请观察时间曲线选择最低荧光值作为RFU0进行污染判断。

 

Ver.CN20230816